Actualités
Félicitations à Ruth Souza, Elise Arbeille, Fabien Durbesson, Vincent Bertrand, Léopold Kurz, Olivier Zugasti, Nathalie Caruso, Cédric Matthews, Florian Roguet, Fabienne Lamballe.
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Félicitations à nos jeunes et talentueux doctor.e.s
5 étudiants ont soutenu leur thèse avec succès entre septembre 2022 et janvier 2023.
Une ERC Synergy Grant pour le projet BREAKDANCE
Le groupe Lenne, ainsi que trois autres groupes, Merkel (CNRS), Trivedi (EMBL) et Ruprecht (CRG), se lancent dans ce projet !
Sonder l’organisation des protéines géantes des muscles avec des nanocorps
Les sarcomères des drosophiles sondés à l’échelle nanométrique une molécule à la fois à l’aide de nanocorps.
Comment une perturbation entraîne le changement
L’interaction entre la formation des jonctions serrées et les signaux liés à la gastrulation régule la différenciation du mésendoderme dans les hiPSCs
Montre-moi ton rythme !
Phasik est un algorithme permettant d’extraire les phases des systèmes biologiques en regroupant des réseaux temporels partiels.
MYC et MET, les “Bonnie and Clyde” du foie
Une nouvelle coopération génique agissant sur le cancer du foie a été découverte chez des patients et documentée fonctionnellement in vivo
Plusieurs prix obtenus par des membres de l’IBDM !
Félicitation à Aziz Moqrich, Sophie Chauvet et Stefan Harmansa.
L’Institut de biologie du développement de Marseille recrute des chefs d’équipe.
L’IBDM lance un appel à candidatures pour des postes de chef d’équipe. Nous recherchons des candidats qui définissent et abordent des questions fondamentales en biologie, notamment le développement, la fonction et la dynamique des systèmes biologiques complexes.
Visite de Thierry Lhermitte à l’IBDM
L’équipe d’Aziz Moqrich a eu la visite de l’acteur et parrain de la fondation pour la recherche médicale Thierry Lhermitte.
Organiser les organisateurs
Une nouvelle perspective pour aborder le domaine très complexe de la polarité cellulaire.
Robert G. Kelly, lauréat du Grand Prix Lamonica de Cardiologie 2022
Robert G. Kelly est le lauréat du Grand Prix Lamonica de Cardiologie 2022 – Fondation pour la Recherche Biomédicale PCL de l’Académie des Sciences.
Identité régionale dans la voie efférente du coeur
PPARγ et NOTCH établissent des programmes distincts dans la voie efférente cardiaque
10 projets ont été sélectionnés pour financement par l’ANR
Congratulations to Pascale Durberc, Lucile Miquerol, Aziz Moqrich, Thomas Lecuit, Benjamin Prud’homme, Laurent Fasano, Laurent Kodjabachian, Robert Kelly, Camille Boutin and Sham Tlili.
Auto-organisation des muscles humains in vitro
Les cellules musculaires s’auto-organisent en faisceaux de fibres in vitro, sans la présence de signaux externes !
Epigénétique et hiérarchie tumorale
Les facteurs épigénétiques PRC2 et MLL1/2 guident les programmes développementaux dans les tumeurs
Des facteurs chromatiniens PRC1 assurent la robustesse de la différenciation des neurones
L’équipe Bertrand a identifié un role pour des facteurs chromatiniens PRC1 dans la robustesse de l’identité des neurones contre le bruit dans l’expression des gènes et les perturbations environnementales.
Frank Schnorrer élu membre de l’EMBO
L’EMBO élit 67 nouveaux membres et membres associés. Ils rejoignent la communauté de plus de 1 900 scientifiques du vivant de premier plan en Europe et au-delà.
Cell-state transitions and collective cell movement generate an endoderm-like region in gastruloids
L’équipe de Lenne a publié dans Elife : En utilisant des gastruloïdes (agrégats 3D de cellules souches embryonnaires de souris), l’équipe a étudié, à une résolution cellulaire, la spécification de l’endoderme.
Targeted Tshz3 deletion in corticostriatal circuit components segregates core autistic behaviors
Nos résultats apportent un éclairage nouveau sur l’implication du circuit corticostrié dans les TSA.
Nerveux Mais Sympathique !
Dans cette étude, l’équipe de Mann a montré que le développement du cancer du pancréas favorise le branchement et la croissance des axones sympathiques.
Un mécanisme pour expliquer la spécialisation d’isoformes d’actines malgré leur similarité
Nos résultats permettent de proposer un modèle simple et efficace sur la façon dont le vivant a pu générer de nouvelles fonctions grâce à l’utilisation de nouveaux isoformes d’actine.
Haploinsufficiency of the mouse Tshz3 gene leads to kidney defects
Les données publiées dans Hum Mol Genet. confirment que les souris hétérozygotes Tshz3 constituent un modèle qui reproduit un grand nombre des problèmes cliniques signalés chez les patients avec une délétion hétérozygote de TSHZ3.
L’Institut de biologie du développement de Marseille recrute des chefs d’équipe
The selected candidates will receive support to establish a group in a fully renovated building, have access to cutting-edge scientific core facilities, and will be assisted in obtaining a tenured position, and in securing extramural funding.
TAFA4 relieves injury-induced mechanical hypersensitivity through LDL receptors and modulation of spinal A-type K+ current
Nous avons montré qu’après SPNS, des neurones inhibiteurs de la lamina II interne (LIIi) et des neurones excitateurs de la lamina II externe (LIIo) présentent des altérations d’un courant K+ transitoire (IA) qui augmente dans des neurones inhibiteurs de la LIIi et diminue dans des neurones excitateurs de la LIIo.
Lydia Kerkerian-Le Goff was awarded the Chevalier de la Légion d’Honneur
Lydia Kerkerian-Le Goff, Research Director at the CNRS and head of the Cellular Interactions, Neurodegeneration and Neuroplasticity team at the Marseille Institute of Developmental Biology (IBDM)
Ardem Patapoutian, shares the honours of his Nobel Prize with his former post-docs and students
Ardem Patapoutian shares the honours of his Nobel Prize with his former post-docs and students including Aziz Moqrich, Chronic pain : Molecular and cellular mechanisms
7 équipes de l’IBDM ont reçu une bourse ANR
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Formation d’interfaces contractiles polarisées par une asymétrie auto-organisée des GPCR Toll-8/Cirl.
Jules Lavalou and Qiyan Mao from Thomas Lecuit’s team report that Toll-8 controls myosin-II planar polarity in Drosophila embryos and wing discs via a physical interaction with the GPCR Cirl/latrophilin.
Pourquoi ne pas ANNOtater et ‘MINEr’ vos données ChIP-seq avec AnnoMiner ?
Nous présentons ‘AnnoMiner’, un nouvel outil convivial basé sur le web pour annoter et intégrer les données épigénétiques et de liaison des facteurs de transcription.
Regardez le ‘TIME’ dans votre réseau d’interaction
L’équipe Habermann a adapté le concept des réseaux multicouches généralement utilisés pour intégrer différents types de données.
Une nouvelle méthode pour imager l’expression des gènes in vivo.
Antoine Barrière et Amel Toudji-Zouaz de l’équipe Bertrand ont développé une nouvelle méthode permettant de visualiser la transcription des gènes in vivo.
Tafalgie Therapeutics, une nouvelle start-up issue des travaux de l’équipe d’Aziz Moqrich
Issue des travaux de l’équipe d’Aziz Moqrich « douleur chronique : mécanismes cellulaires et moléculaires », Tafalgie Therapeutics est une nouvelle start-up créée en novembre 2020.
Les myofibrilles des muscles façonnent leurs mitochondries et vice versa
En combinant la génétique chez la drosophile avec l’imagerie de pointe et le “deep-learning”, des chercheurs de l’IBDM ont découvert que les mitochondries coordonnent leur formation avec le développement des myofibrilles pour correspondre au bon type musculaire.
Prix de Thèse 2021 de la Société Française de Biologie du Développement (SFBD) pour Alexandre CHUYEN
Alexandre CHUYEN, qui a préparé sa thèse de doctorat sous la direction d’Andrea Pasini dans l’équipe Kodjabachian a obtenu le Prix de Thèse 2021 de la SFBD.
Distanciation sociale : Les cellules montrent l’exemple !
Une étude publiée dans Developmental Cell par l’équipe Kodjabachian dévoile comment les cellules multiciliées se distribuent à intervalles réguliers dans l’épiderme embryonnaire du xénope.
Identification d’une fonction générique des protéines Hox dans le tube neural chez les vertébrés
L’équipe de Yacine Graba et Andrew Saurin vient d’identifier une fonction atypique des gènes HoxB au cours du développement de la moelle épinière.
Identification d’une famille de nucléotides fluorescents se liant à l’actine
L’équipe d’Alphée Michelot, en collaboration avec l’équipe de Pekka Lappalainen (Université d’Helsinki), a identifié et caractérisé une famille d’analogues nucléotidiques fluorescents très sensibles et structurellement compatibles avec l’actine.
Une nouvelle cible pour contrôler la différenciation et le potentiel tumorigène des cellules souches pluripotentes induites humaines
The teams of F Maina and L Kerkerian-Le Goff publish in Stem Cells Translational Medicine a work led by Rosanna Dono showing that levels of the signal modulator GLYPICAN-4 are critical for the generation of midbrain dopamine neurons from human induced pluripotent stem cells and for overcoming their tumorigenic properties.
Transvection regulates the sex-biased expression of a fly X-linked gene.
Une publication de l’équipe de B. Prud’homme révèle de quelle manière le profil d’expression sexuellement différencié d’un gène lié au chromosome X est contrôlé par l’interaction entre les allèles de ce gène, un phénomène connu sous le nom de transvection.
La voie Hippo contrôle la croissance musculaire
L’équipe de Schnorrer et al. ont découvert qu’une voie de signalisation, appelée voie Hippo, contrôle la croissance musculaire pendant le développement des muscles du vol, chez la drosophile.
L’équipe Maina publie dans le Journal of Hepatology
L’équipe a découvert que ADAMTSL5 est un oncogène épigénétiquement activé et surexprimé chez une grande partie des patients humains atteints de HCC et dans des modèles murins de HCC.
EPySeg: a coding-free solution for automated segmentation of epithelia using deep learning
Benoit Aigouy (équipe de B. Prud’homme), a développé EPySeg, un logiciel libre qui utilise de l’apprentissage profond pour segmenter les contours cellulaires d’un épithélium, de n’importe quel organisme, de manière automatique et très efficace.
Regulatory encoding of quantitative variation in spatial activity of a Drosophila enhancer
Une publication de l’équipe de Benjamin Prud’homme, en collaboration avec celle de N. Gompel, explore de la relation entre les informations quantitatives l’activité spatiale codées par les séquences cis-régulatrices d’un gène de développement.
Comment se construit le circuit électrique du cœur de souris ?
L’équipe Kelly publie dans Nature Com. une étude réalisée par C. Choquet et L. Miquerol sur la mise en place des fibres de Purkinje cardiaques qui servent de cables électriques dans les ventricules pour synchroniser les battements cardiaques.
Comment les cellules souches neurales du cerveau sont différenciées
Dans un article publié dans Elife, Nathalie Coré de l’équipe Cremer décrit une nouvelle cascade de régulation, impliquant des facteurs de transcription et un microARN, qui contrôle comment les cellules souches neurales déterminent quel type de neurone elles produisent.
Pierre-Francois Lenne élu membre de l’EMBO
Le 7 juillet 2020, 63 scientifiques de renom ont été élus membre de l’European Molecular Biology Organization (EMBO), en reconnaissance de leurs remarquables réalisations dans le domaine des sciences de la vie.
Mature oligodendrocytes bordering lesions limit demyelination and favor myelin repair via heparan sulphate production
Une étude récemment publiée dans elife par l’équipe de P. Durbec en collaboration avec A. Williams a montré que les cellules OLG matures épargnées par le processus dégénératif entourant les lésions démyélinisées contribuent également à ce mécanisme de réparation en produisant des HS et en modulant la voie de signalisation Shh.
Drosophila Aversive Behavior toward Erwinia carotovora carotovora Is Mediated by Bitter Neurons and Leukokinin
Dans un article récent publié dans iScience, Bernard Charroux, Fabrice Daian and Julien Royet analysent le comportement de drosophiles simplement mises en contact avec des bactéries potentiellement pathogènes pour elles.
Régulation des divisions asymétriques de progéniteurs neuronaux par des ligands Wnt
Dans une étude collaborative publiée dans Development, les équipes de Vincent Bertrand et de Pierre-François Lenne ont analysé le rôle de ligands Wnt lors des divisions générant des neurones au cours du développement du système nerveux.
Cardiopharyngeal mesoderm origins of musculosketelal and connective tissues in the mammalian pharynx
Dans une étude publiée dans Development, Adachi et al ont utilisé le traçage du lignage génétique pour étudier l’origine cellulaire de la gorge chez la souris.
Loss of bhlha9 impairs thermotaxis and formalin-evoked pain in a sexually dimorphic manner
Dans une étude publiée dans Cell Reports, Bohic et al. confirment le rôle des C-LTMR dans la modulation de la douleur inflammatoire en inactivant le facteur de transcription bhlha9.
L’équipe Maina, en collaboration avec avec l’équipe de recherche imXgam (CPPM) et des chercheurs du CIML et de Cerimed, publie dans iScience
Les pixels du CERN ont permis de suivre la croissance de tumeurs spontanées chez la souris.
Mechanical stiffness of reconstituted actin patches correlates tightly with endocytosis efficiency
Une collaboration multi-disciplinaire entre l’équipe d’Alphée Michelot et l’équipe d’Olivia du Roure et de Julien Heuvingh à l’ESPCI publie dans PLoS Biology une étude montrant que la rigidité mécanique des patchs endocytiques d’actine est fortement liée à l’efficacité de l’endocytose.
Neuronal integration in the adult mouse olfactory bulb is a non-selective addition process
Une étude récente mené par Jean-Claude Platel de l’équipe d’Harold Cremer publié dans Elife a pu montrer que ces neurones nouvellement générés s’additionnent de façon permanente dans le réseau neuronal du bulbe olfactif entrainant une augmentation de la population neuronale ainsi que de la taille du bulbe olfactif.
Les mécanismes des cancers du cerveau avec une origine développementale révélés par la drosophile
Dans un travail récent publié dans eLife, l’équipe de Cédric Maurange identifie un programme génétique organisant l’hétérogénéité métabolique des cellules dans un modèle de tumeur neurale pédiatrique.
Peptidoglycan-dependent NF-κB activation in a small subset of brain octopaminergic neurons controls female oviposition
Julien Royet’s team uses the genetic tools generated in the fruit fly to dissect the molecular interactions between bacteria and the host’s nervous system.
ERC Synergy Grant pour la recherche sur le muscle
Le Conseil européen de la recherche (ERC) a attribué l’un des rares financements ERC Synergy à un consortium international de scientifiques, Frank Schnorrer, Stefan Raunser, Dirk Görlich et Mathias Gautel.
Shaping Life 2
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Le développement embryonnaire comme une vague de stade
Dans une étude récente parue dans la revue internationale Nature, Thomas Lecuit et ses collègues de l’Institut de Biologie du Développement de Marseille décrivent comment les changements de forme des tissus sont auto-organisés.
Contrôle de la taille des réseaux d’actine des cellules
L’équipe d’Alphée Michelot publie dans Plos Biology un article expliquant comment les cellules contrôlent la taille de multiples réseaux d’actine au sein d’un cytoplasme commun.