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INSTITUT DE BIOLOGIE DU DEVELOPPEMENT DE MARSEILLE

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EPySeg: a coding-free solution for automated segmentation of epithelia using deep learning

Benoit Aigouy (équipe de B. Prud’homme), a développé EPySeg, un logiciel libre qui utilise de l’apprentissage profond pour segmenter les contours cellulaires d’un épithélium, de n’importe quel organisme, de manière automatique et très efficace.
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Delphine Dauga
Biocurator at Bioself
Date de publication

Benoit Aigouy, de l’équipe de Benjamin Prud’homme, a développé EPySeg, un logiciel libre qui utilise de l’apprentissage profond pour segmenter les contours cellulaires d’un épithélium, de n’importe quel organisme, de manière automatique et très efficace. EPyseg, qui peut être utilisé localement ou via Google Colab, (cloud) permet d’accélérer et d’améliorer la caractérisation des épithélia pour tous les biologistes du développement intéressés par la morphogénèse tissulaire.

EPyseg illustration

En Savoir Plus :

Development 2020 Dec 2;dev.194589. doi: 10.1242/dev.194589.

Contact

Benoit Aigouy – Benoit Aigouy
Benjamin Prud’homme – Benjamin.prudhomme@univ-amu.fr

 

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